{"id":1697,"date":"2020-03-25T21:05:20","date_gmt":"2020-03-25T20:05:20","guid":{"rendered":"https:\/\/www.muycomputerpro.com\/universo-lenovo\/?p=1697"},"modified":"2020-03-28T21:05:49","modified_gmt":"2020-03-28T20:05:49","slug":"bgi-genomics-coronavirus-intel-lenovo","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.muycomputerpro.com\/universo-lenovo\/bgi-genomics-coronavirus-intel-lenovo\/","title":{"rendered":"BGI Genomics y la lucha por vencer al coronavirus con apoyo de Intel y Lenovo"},"content":{"rendered":"<p>La lucha contra el coronavirus implica tambi\u00e9n una carrera contrarreloj en el mundo de la investigaci\u00f3n. Desde sus primeras etapas, que implican la secuenciaci\u00f3n del genoma del COVID-19. En ello trabajan centenares de investigadores no solo de China, sino tambi\u00e9n del resto del mundo. Hasta la fecha ya se han producido varios avances en este aspecto, y los investigadores ya <strong>han secuenciado algunos genomas del COVID-19<\/strong>, lo que sienta las bases esenciales para poder luchar contra \u00e9l.<\/p>\n<p>Pero como hemos comentado, esto es solo el principio. M\u00e1s importante que eso, aunque tambi\u00e9n m\u00e1s complicado, para poder entender esta pandemia, es la <strong>secuenciaci\u00f3n de los genomas de las personas infectadas<\/strong>. Solo de esta forma se podr\u00e1 responder a preguntas sobre por qu\u00e9 es este virus m\u00e1s contagioso que otros, y qu\u00e9 mecanismos llevan a la neumon\u00eda y la hospitalizaci\u00f3n de algunos enfermos y no de otros. Las respuestas est\u00e1n en alg\u00fan punto entre la interacci\u00f3n entre el genoma de un individuo y las cepas que les infectan. Una vez mapeados, los puntos de interacci\u00f3n impulsados por ADN llevar\u00e1n a <strong>diagn\u00f3sticos, vacunas y terapias<\/strong>.<\/p>\n<p>Los investigadores de <strong>BGI Genomics<\/strong>, los que <strong>desarrollaron los primeros kits de diagn\u00f3stico<\/strong> para la enfermedad, y otros equipos alrededor del mundo est\u00e1n en medio del proceso de la gen\u00f3mica a escala para combatir el COVID-19. Pero para dar vida a una vacuna o a otras medidas de protecci\u00f3n, los cient\u00edficos necesitan grandes conjuntos de datos para dar con las diferencias gen\u00e9ticas que puedan ser protectoras. El trabajo a esta escala genera ingentes cantidades de datos. Demasiados para procesarlos sin an\u00e1lisis a gran escala, para lo que se necesita <strong>equipos de computaci\u00f3n de alto rendimiento<\/strong>.<\/p>\n<p>Como tantos otros centros de investigaci\u00f3n, por tanto, en BGI Genomics necesitan equipos potentes. Y aqu\u00ed es donde entran en escena <strong>Lenovo<\/strong> e <strong>Intel<\/strong>, que se han unido para <strong><a href=\"https:\/\/news.lenovo.com\/supercomputers-genome-sequencing-race-to-decode-coronavirus-bgi\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">donar un cluster de superordenadores<\/a> dedicados<\/strong>, as\u00ed como el software y la experiencia en hardware necesarias para sacar el m\u00e1ximo partido.<\/p>\n<p><strong>Mileidy Giraldo<\/strong>, <strong>Responsable de investigaci\u00f3n y desarrollo en gen\u00f3mica de Lenovo<\/strong>, ha subrayado que \u00ab<em>estamos donando equipamiento y experiencia, pero el aut\u00e9ntico avance y contribuci\u00f3n llegar\u00e1 con lo que consigan los investigadores de BGI y el resto de la comunidad biom\u00e9dica con base en los descubrimientos de BGI<\/em>\u00ab.<\/p>\n<p>La donaci\u00f3n de este cl\u00faster de superordenadores permitir\u00e1 a los investigadores <strong>acceder a la potencia de computaci\u00f3n que necesitan<\/strong> para ensamblar y analizar cientos de genomas completos y miles de exomas. Seg\u00fan Giraldo, \u00ab<em>con esta donaci\u00f3n, nuestra esperanza es ampliar los recursos que tienen a su disposici\u00f3n los investigadores de BGI para que la comunidad biom\u00e9dica pueda hacer m\u00e1s y cumplir objetivos con m\u00e1s rapidez. No puedo pensar en un ejemplo mejor del uso de la tecnolog\u00eda para enfrentarse a los desaf\u00edos m\u00e1s grandes de la humanidad que uno en el que un equipo multidisciplinar de cient\u00edficos, m\u00e9dicos e ingenieros se han unido para utilizar su potencia de sabidur\u00eda combinada para luchar contra la pandemia global del coronavirus<\/em>\u00ab.<\/p>\n<p>A parte de una potente soluci\u00f3n desarrollada por Intel, <strong>Lenovo desarroll\u00f3 un hardware optimizado<\/strong> y una arquitectura de sistemas para reducir de forma radical los tiempos de proceso de los genomas. La sokuci\u00f3n de Lenovo para genomas a nivel de poblaci\u00f3n, la <strong>Herramienta de escalabilidad y optimizaci\u00f3n de genomas (GOAST)<\/strong>, aprovecha el <strong>Kit de herramientas de an\u00e1lisis de genomas (GATK)<\/strong> open source del Instituto Broad, funcionando con una base de hardware optimizado. Identificar las optimizaciones correctas y los bloques de desarrollo hardware para acelerar la gen\u00f3mica precis\u00f3 de la prueba de cientos de configuraciones de computaci\u00f3n de alto rendimiento.<\/p>\n<p>Como resultado, el sistema obtenido permite reducir el tiempo necesario hasta conseguir <strong>obtener un genoma humano completo en cinco horas y media<\/strong>, y exomas en solo cuatro minutos. Es una velocidad cuarenta veces superior a la que alcanzaban sin este equipamiento. Esto permitir\u00e1 que los investigadores de BGI est\u00e9n pronto concentrados en el estudio del COVID-19 para dar con una vacuna.<\/p>\n<div class=\"wpb_text_column wpb_content_element \">\n<div class=\"wpb_wrapper\">\n<p>A corto plazo, la predicci\u00f3n de la virulencia bas\u00e1ndose en las cepas dominantes en un paciente puede que ayuden tambi\u00e9n a los hospitales a <strong>realizar triajes m\u00e1s eficaces<\/strong> en los pacientes. As\u00ed sabr\u00e1n quien tiene m\u00e1s riesgo tan pronto como lleguen a un hospital. Tambi\u00e9n qu\u00e9 terapias pueden ser las m\u00e1s eficaces en su caso. A largo, incluso despu\u00e9s de conseguir una vacuna, el genoma del COVID-19 puede ofrecer pistas sobre su origen. Conocer su historia gen\u00f3mica y el punto de origen puede ayudar a predecir y prevenir brotes en el futuro.<\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>La lucha contra el coronavirus implica tambi\u00e9n una carrera contrarreloj en el mundo de la investigaci\u00f3n. Desde sus primeras etapas, que implican la secuenciaci\u00f3n del genoma del COVID-19. 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