Lenovo está colaborando con el Instituto de genómica y biología integrada CSIR-IGIB, el instituto de secuenciación genómica más prestigioso de la India para avanzar en la investigación contra el cáncer profundizando aún más en las raíces genéticas de la enfermedad. El acuerdo pone a disposición del instituto la arquitectura de la herramienta de Optimización y escalabilidad genómica de alto rendimiento de Lenovo (GOAST), con procesadores Intel Xeon Scalable de 2ª generación.
La potencia de esta herramienta permite al CSIR-IGIB trabajar con cargas de trabajo de secuenciación genómica altamente intensivas, además de ayudar a los investigadores a encontrar información con más rapidez. GOAST cuenta con una arquitectura de computación de alto rendimiento desarrollada específicamente para las cargas de trabajo genómicas de alta demanda, lo que lo convierte en un elemento de contribución a esta iniciativa de gran importancia.
Codo con codo con Lenovo, el CSIR-IGIB ha desplegado un sistema de 28 nodos, lo que supone la mayor instalación de GOAT en India hasta la fecha. Aprovechando una arquitectura optimizada y un software open source eficiente, GOAST ofrece rendimiento a nivel de GPU pero con costes a nivel de CPU. De esta manera se convierte en una propuesta atractiva para un organismo púbico como el CSIR-IGIB.
El instituto ha experimentado un impacto en rendimiento significativo gracias al sistema GOAST de Lenovo, tanto en cargas de trabajo de secuenciacion genómica (WGS) como en las de secuenciación del exoma completo (WES). En ejecuciones de latencia, donde todos los recursos de un nodo se asignan a la ejecución de una única tarea, el instituto puede completar un flujos de trabajo típico de WGS y WES 6,5 veces más rápido.
Esta aceleración de la velocidad de ejecución permite a los investigadores procesar más muestras y responder más preguntas complejas en menos tiempo: de 60,5 horas a 9 horas. Al registrar un ritmo de investigación más rápido, el CSIR-IGIB es capaz de impulsar más el trabajo científico vital, y de conseguir los avances necesarios para mejorar su comprensión de enfermedades como el cáncer, así como de encontrar tratamientos mejores que mejoren los resultados de los pacientes e incluso salven vidas.
La arquitectura de Lenovo soportará cualquier conjunto de iniciativas de investigación, incluyendo las centradas en la exploración de las raíces genéticas potenciales del cáncer. Por ejemplo, los investigadores pueden comparar los genomas del cáncer con un genoma de referencia estándar para identificar potenciales mutaciones que pasen directamente de un padre a un hijo y que pueden activar o hacer crecer el desarrollo del cáncer en humanos.
Esto también permitiría mejorar nuestra comprensión de los cambios genéticos que puedan contribuir a originar un cáncer. Este análisis puede además ofrecer información valiosa sobre cómo puede evolucionar el cáncer de una persona, así como su respuesta probable al tratamiento.